國立臺灣大學昆蟲學系-整合生物學專題討論報導
講題：Unveiling speices’ genetic traits and diverse phenotype through comparative genomics
演講者：柯惠棉助理教授 東吳大學微生物學系
撰寫者：林彥旻
專題演講報導
昆蟲系於2025年5月20日邀請東吳大學微生物學系柯惠棉助理教授蒞臨演講，講題：Unveiling speices’ genetic traits and diverse phenotype through comparative genomics。昆蟲系於2025年5月20日邀請東吳大學微生物學系的柯惠棉助理教授，來向師生分享比較基因體學 (comparative genomics) 在探討遺傳特徵和表型多樣性的應用。以螢光蕈類為例，這群會發出生物螢光的傘菌分成三大類：類臍菇支系 (Omphalotus lineage)、蜜環菌支系 (Armillaria lineage) 與小菇科支系 (Mycenoid lineage)。由於它們各自的姊妹群皆不會發出生物螢光，且各支系下具發光能力的物種比例並不相同，螢光蕈的演化路徑就成了懸而未決的問題。柯老師首先以螢光基因建立三個支系的親緣關係樹，證實了螢光基因起源自一共同祖先，而三大支系以外的類群則在演化過程中各自失去了發光能力。柯老師進一步比對螢光基因在各物種基因體中的位置，發現小菇科的螢光基因在基因體中的位置差異極大，代表小菇科的螢光基因坐落在基因體中相對不穩定的區域，而容易因跳躍子等因素失去作用，在分子層面上解釋了為什麼小菇科中僅有約一成的物種具有生物螢光；與此同時，蜜環菌的基因體保守度極高，解釋了為何蜜環菌所有物種皆保有生物螢光的能力。在次世代定序技術日臻成熟的今天，過往那些僅透過少數片段基因難以回答的問題，現在可以透過定序整個基因體來提供更完整的比較與更準確的分析。柯老師的研究不僅證明了螢光蕈類的演化歷史，更為螢光蕈類，乃至於其他生物的後續研究提供了比較基因體學的研究基礎。
